Hola Andrés, esto puede deberse a muchas causas, te hago una mini guia para que revises cosas que pueden estar mal:
-Al abrir pronterface, debes ver que se conecte a tu Arduino, si no hay conexión, vamos mal.... xD Lo que te debería llevar a mirar si tienes los drivers correctos para que tu ordenador detecte tu Arduino.
-Si detecta la placa, mira que tengas bien configurada la tarjeta, si usas una RAMPs debes poner en #motherboard el parámetro correspondiente a esta placa.
-Comprueba que has puesto los jumpers debajo de los pololus y que la configuración de pasos es correcta. Yo te recomiendo que lo configures a 16 micropasos.
-Revisa la alimentación!! si usas una RAMPs puedes alimentar por 2 sitios, uno da corriente a la base caliente y el otro sitio a los motores y HotEnd, si está en el lugar que no es no se moverán los motores.
Revisa estas cosas y me cuentas que tal te ha ido
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